却因凌霜的重生，打乱了他的全盘算计，使得早应该在明德八年身死的关鳌活着，并且牢牢保持着大顺兵权，弄得玄烈无可奈何。
这边玄烈和关鳌君臣僵持，各逞机心，便让三大藩王觉得朝廷没用，欲起兵自立，夺取大顺王朝。
明德十三年四月，桂王吴德在云南起兵造反，杀云南巡抚朱国治，拘捕了按察使以下不顺从的官员，发布檄文，自称“原镇守山海关总兵官，今奉旨总统天下水陆大元帅大将军”，佯称拥立“前朝三太子”，讨伐无道大顺，致书喜王和忠王二藩及各地故旧将吏一起出兵，三藩之乱由此而起。
三藩起兵造反，震动朝廷，玄烈怒不可遏，下旨平乱，欲拿三王项上人头以立朝廷之威。
三藩割据一方，兵多将广，三大藩王也是将领出身，谙熟兵法，作战勇猛，占据有利地形，很快就将朝廷派出去的军队杀得节节败退，溃不成军。
战败的消息传来，玄烈不但颜面尽失，而且感觉自己的江山受到了严重的威胁。
这一次朝廷出兵平乱，之所以输得那么惨，一方面固然是军队不够精锐，不敌三大藩王的精锐之师，另外一方面则是因为红莲会的缘故，红莲会虽说不是正儿八经的军队，会中却不乏武林高手。
有道是‘射人先射马，擒贼先擒王’，红莲会一直致力于推翻大顺，复兴前朝，擅于搞暗杀行动，大顺领兵的将领，有一半都死于红莲花乱党的暗杀，将领一死，大军群龙无首，溃不成军，很容易就被逐个击破。