成为大蛇丸的隐秘弟子，不在柳川一直的计划内，柳川向来不喜欢和大蛇丸接触，这一位人性的滑落速度和他实验的进程息息相关，在柳川的印象中，叛逃木叶之前，大蛇丸已经在不顾一切的用木叶的忍者，进行人体实验，整个人已经到了疯魔的边缘。
但是，柳川隐隐意识到，大蛇丸在乎的东西，或许就是他一直表现的极为冷淡的感情，永生不过是他逃避的最直接的办法罢了。这种猜测或许可笑，却可以解释很多事情。
大蛇丸的隐秘实验室真正对柳川开放，柱间细胞的培养皿，木遁婴儿的实验室，八尾牛角实验室，白鳞大蛇的实验室，人体改造实验室，以人体改造为核心，诸多的禁术书便封存在内。
人体实验室柳川很眼熟，应该就是将来三代发现大蛇丸的那一间，也是大蛇丸最常驻的地点，禁术再生之术，也被封存在这间实验室中。
跟柳川想象中不同，柱间细胞，大蛇丸目前其实根本不看重，就和移植的血轮眼一样，这种不稳定的力量，向来不在大蛇丸的视线中，这个项目完全是为了团藏开发的，这是他们二人的合作项目，也是大蛇丸骗取研究经费的项目，现在柳川愿意接手，他便将这个项目推给了柳川。
柳川虽然知道柱间细胞的用处，但是柱间细胞的侵蚀性不是目前的柳川体质可以抵抗的，在对柱间细胞的利用上，即使是团藏和宇智波斑使用的方法都过于粗暴，还是后期的大蛇丸可以彻底将柱间细胞融入体内，表面看不出破绽，甚至自己的血液都可以将兜逐渐蛇化，保留了柱间细胞的恢复能力的同时，削弱了细胞的侵蚀力，当然，同时也失去了木遁的能力，但那是很久远的事情了，至少要到三战之后。
与此同时，柳川计划中的禁术再生之术，也轻松到手，甚至还有意料之外的惊喜，柳川一直想要学会的医疗忍术中强大的两个分支，掌仙术和查克拉手术刀，以及幻术中的黑暗夜行之术也在其中。