“朕说这奏折有意思，就有意思在这一点，那些人，果然跟大哥分析的一样，就是看新军不顺眼。先是瞒着朕，卡新军的钱粮供应，现在又借着收复疆土的旗号，要让新军去三边杀敌。套是要复的，新军，却不能动。朕的意思是，徐徐图之，先用几年时间积蓄钱粮，训练士卒。等到养成气力之后，再去收复河套也不晚。”
杨承祖对于新军的建设，还是按着军官团的构想，这五营新军的意义不在于自己这一万五千战力，而在于其作为教导队，可以去训练其他部队。按照他与嘉靖的想法，这五营新军进京之后，接下来就是对三大营的改编，重新编练，一方面用新军镇场子，另一方面，把新军的骨干作为军官派到三大营里，按新军标准进行编练。
虽然三大营糜烂以久，不过几万战力还是凑的出来的，再以募勇选锋等方式，二十个营以上的新军不成什么问题。按照新军的模式训练，即便是战斗力无法达到新军标准，对皇帝个人的忠诚度也能提高到新军的层次。
这里面，自然要有和朝内勋贵的勾兑，京师勋贵经营多年，与三大营内的关系盘根错节，有他们协助，工作上就容易开展。以往文官在三大营或是军队里伸手的方法，就是控制部队的补给，通过拿捏部队的生命线，保证自己的力量能渗透到军队里。
再者，军人并没有多少文化，在他们眼里，世间的道理还是掌握在读书人手里的，一个饱学之士说的话，他们下意识的就会接受。这也是社会整体上，认可万般皆下品，惟有读书高的社会氛围下，形成的意识。是以读书人对于士兵的控制，比起武人来，先天上是有优势的。
杨记的存在，使得部队的补给方面，不用再像过去一样依赖于文官系统，加上勋贵的合作，新军的整编完全可以自己进行，不给外人插手的空间。可是也正是因为这样，一部分大臣心里不满意，也就千方百计的想办法，给新军找不痛快。
前者新军刚到京时，就有人卡过新军的补给，想要让这些人先在京师附近劫掠行商，把名声搞坏。没想到新军的纪律性太强，加上福利及家属各方面的考虑，长官命令下，士兵在营里挨饿，没人敢出来搞破坏。预先的安排，没能发挥作用，这次就只能借刀杀人，借天子好军功的想法，想要把新军调出京师。
杨承祖在这件事发生之前，已经把这种可能想到了，嘉靖也就没上当。但是天子显然没准备就这么算了。“大哥，你回去之后查一查，这个王启年是受谁的指使。这种小角色，朕不去理他，可他背后的人，不能就这么算了。还有，这些言官仗着风闻言事无罪的权力，跳的太凶，朕要好好收拾他们一下，你帮朕想个办法。”
“言官风闻言事无罪，乃是祖宗家法，当年洪武爷爷设这个家法时，想的可是让他们帮着皇帝，制约宰相。洪武爷爷设锦衣制约百官，主要还是防范武臣造反。以言官制约宰相，是为了以小制大，以免走上宋朝相权过大，天子连杀个人都不能自主的旧路。可惜啊，后来锦衣名存实亡，言官却倒戈到了六部及首辅那边，跟天子作对。万岁若想乾纲独断，还是得像洪武爷爷那样，让言官为我所用，让他们咬谁，他们就咬谁。要想做到这一步，就得换血，培养出一批，完全忠于天子的士人担任言官。在那之前，就只有用言官来制约言官了。”