姜炎携同女登周游世界，并在凡人身上见证生老病死，于是从炼丹法门中提取药学，并尝百草完善药理，撰写出《神农百草经》。
伏羲退位人皇，神农炎帝退位。
之后道祖出现，以伏羲不隐神农不出为由困伏羲于火云洞。
李玄受道祖的霸道而感到无力。
岁月悠悠，春去秋来。
巫族部族有大巫蚩尤建立蚩尤部，人族有贤才轩辕氏建轩辕部族。
随时间的流逝，逐渐变成神农炎帝、轩辕黄帝、蚩尤三族争霸的格局。
黄帝师从阐教，后在阐教的力量相助下败蚩尤。
后，神农炎帝退位，亦居火云洞。
李玄眼睁睁看着一代代人皇攀上高峰却又被限制自由，下定决心不再奢望道祖会对他们这群蝼蚁怀有仁慈。
默默等到五帝时期结束，李玄明修栈道暗度陈仓，将火云洞直接挪往幽冥界，并设天地人三大帝及五方鬼帝。
人界与冥界的开始气运紧紧相连。
有幽冥之主平心在，道祖无奈做出妥协，承认李玄所做之事，却又将泰山府君东岳大帝的名头安在了他头上，并受天庭管辖。
至此，天地人三界隐隐成为一体。
而后，李玄借昊天分神下凡之际化身教导，并在昊天重新归位后拉进了与其的关系，天帝一系与他的关系有了转变……玄都也有了新称号，五显灵观大帝——玉帝之师。
之所以为玉帝之师，是因为在此期间天帝昊天携瑶池受玄都影响，决心以生灵为本治理三界，无奈被道祖破坏，天帝天后化玉帝王母。