明代黄河泛滥严重，后世曾有学者专门研究这其中的原因，总结出以下几点原因：
一、气候变化
早在8000-3000年前，这东方大陆还处于“仰韶温暖期”，年平均气温比后世高3-5度，生长在今温暖又湿润的亚热带地区的动植物推至京津地区。
当时黄河流域降雨量丰富，植被茂盛，人类活动少，即使发生水患，人们可以迁都、疏导、分洪，这黄河的泛滥对于当时的人类威胁还不是太大。
可是随着进入西周以后，气候经历了数次的寒暖交替，也就是那“小冰河时期”，植被的覆盖率与降雨量也发生着变化，直接影响着水土流失的程度，与水患的产生密切相关。
二、生产力发展
明朝随着焦炭冶铁技术的不断成熟，生产工具也在不断改进，生产效率得到了极大的提高，使得明代黄河流域的耕地面积急剧增加。
这耕地的增加虽然对于人类是件好事，但对于大自然却并非好事，古人对于生态环境的保护也没今人那么重视，这就加重了黄河的水土流失，使黄河内的泥沙不断增多，泛滥的风险系数也日益提高。
三、人口骤增
除了耕地的不断增加外，黄河附近的人口也在迅猛增长，这些增长的人口总得烧饭做菜吧！而普通的平民又用不起煤炭，他们大多数都靠着原始的手段去砍伐树木来获取足够的木柴，这样就更加剧了黄河水土流失的情况。
这些或出于自然条件，或出于人为因素，虽然使得黄河堆积的泥沙不断增多，可若是能像后世那般全力治河，也不至于让黄河时常决口，使得百姓们无家可归，受此大难。
这大明治黄失败的主要原因还是在于人！黄河因为时常泛滥，所以年年都要花费重金来修筑河堤。
这可是一项肥差，那些修筑河堤的官员可以借此大捞油水，通过用那些外强中干的豆腐渣材料来充当修堤的材料来中饱私囊。至于因为材料缘故而使得黄河决口，百姓涂炭，这就不是他们考虑的问题了。
他们重视的只是如何逃避朝廷的责难，但这其实也并不困难，只需要扔出几只替罪羊，再花些钱打点下朝中的大官与内廷的太监就行了。
虽然这其中不乏清廉的官员，而且皇帝不是每次都能被糊弄过去的，所以在明朝前期的时候，这黄河决口的频率还算是在明廷可以承受的范围之内。
但明朝中后期，国家经济实力下降，财力不支，水利工程经费也从单独由国家拨款转为地方自筹和民间集资及国家拨款相结合的方式。
这就造成了地方官吏的腐败、农民的日益贫困，致使水利建设更加荒疏，泥沙淤积，河床上涨，每遇河水暴涨的季节，黄河便会决口泛滥。