五代十国时期，万州境域先后为前蜀、后唐、后蜀占据，行政建置仍沿袭唐制，领南浦、武宁、梁山3县。先后属镇江军节度使（先治奉节，后治忠县，又移治奉节）和宁江军节度使（治奉节）。
北宋开宝三年（970年），以万州石氏屯田务置梁山军（亦名高梁郡），领梁山1县。咸平四年(1001年)，置夔州路于奉节，辖万州、涪州、重庆府等地。
元代，世祖至元二十年（1283年），省南浦县入万州，领武宁1县，时属夔州路（今奉节）。
明朝，洪武四年（1371年），并武宁县入万州，洪武六年（1373年）降万州为万县，属夔州府（今奉节）。
清代，沿循明制，属夔州府（今奉节）。光绪二十八年（1902年）9月5日，英帝国主义强迫清政府签订《中英续议通商行船条约》，增辟万县为通商口岸。[民国六年（1917年）设立海关，因长江水道原因，万县成为四川第三大城市，有“成渝万”之称，同时，也成为川东、鄂西、陕南、黔东、湘西的重要物资集散地。[5
6]民国十四年（1925年）7月，段祺瑞政府宣布万县正式开埠，从此万县成为四川省第二个直接报关出口的通商口岸。[4]民国十七年（1928年）11月15日，驻万军阀杨森以万县城区设置万县市。
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