有了王导的精心谋划，司马睿终于在建康站稳了脚跟。随后，王导又助司马睿将建康打造成为江南的政治、军事中心，威名远扬。
因此，司马睿对王导倍加倚重，甚至在登基大典上邀请他同坐御座，令满朝文武大为震惊。王导谦逊地推辞道：“陛下如日中天，我等臣子百姓如万物生长，自当保持距离，以敬天威。”
然而，东晋王朝虽立，根基却并不稳固。中原战乱频发，许多士族为避祸纷纷南渡。王导深知，要巩固东晋在江南的地位，必须广纳贤才。于是，他向司马睿建议，从南渡的士族中选拔德才兼备者入朝为官。司马睿采纳其议，招募百余名北方士族入仕。
然而，这些士族中不乏对东晋持悲观态度者。他们在新亭宴会上，面对长江美景，却感慨不已，认为江南虽好，终非故土。王导闻讯后，严厉斥责他们，鼓励他们以恢复中原为己任，辅佐王室。在王导的激励下，士族们逐渐振作起来，不再沉溺于悲观情绪。
此外，王导还致力于推行富农强军政策，以巩固东晋的统治。他发现江南官员们沿袭了西晋时期石崇、王恺等豪门贵族的奢侈之风，便请司马睿出面禁止此风。他以身作则，穿着粗布衣服，居住在简陋的芦席棚内，以示节俭。在他的影响下，东晋官员们纷纷效仿，不再盲目攀比。
司马睿对王导的忠诚与智慧大加赞赏，将他比作辅佐刘邦的萧何。此后，司马睿对王导言听计从，无论大小事务都与他商议。百姓们见此情景，纷纷传颂“王与马，共天下”的美谈。在王导的辅佐下，东晋王朝逐渐走向稳定与繁荣。