在郑成功的规划下，军权被他牢牢掌握在了手里，民政中最重要的“财权”和“人事权”则是被洪旭，郑泰，卢若腾三人瓜分，分别代表着明郑体系中三股不同派系的力量。
中军下辖的四镇正在加紧训练，特别是“虎卫镇”和“骁骑镇”，这些兵马将是郑成功西征潮惠的主力。有了立足之地后，郑成功就不可能再每次打仗都带着全军出击了。
王秀奇统领的“右军”和黄山统领的“左军”在训练的同时，分别负责北面和东面的防御，多次拦截了清军斥候的试探，表现出了强悍的战斗力。
郑泰继续主管海外贸易，为大军赚取当前最重要的开销来源，并开始谋划在商业上为郑成功拉拢葡萄牙人，制衡西班牙人，打压荷兰人，最终垄断整个日国和南洋的海上贸易做准备。
而这位能力突出，但也贪腐严重的郑氏亲族，也将会在后续的改革中，成为明郑贸易和金融体系的奠基人，只是能走到哪一步，就看其能不能看清楚局势，改弦更张了。
洪旭主管民政中的屯田，道路和水利工程的建设，以及附属于军队的武器工坊，还有农兵的训练。其中“屯田”是今后军队最为重要的粮草来源，前途无限，权力也十分大，而农兵和武器工坊则是郑军战无不胜，越打越强的重要保障。
不过，他的权利很大程度上受到卢若腾的制约，两人在地方治理上只能通过密切合作来完成大部分事情，这确保了洪旭这样具有军队背景的“总理官”难以形成不受控制的独立政治小集团。