雨之国vs风之国
风之国vs火之国
土之国vs雷之国
主要参战人物：
猿飞日斩（木叶领导）
山椒鱼半藏（雨忍领导）
三代目风影（沙隐领导）
两天枰大野木（岩隐领导）
木叶白牙（木叶）
千代（沙隐）
大蛇丸（木叶）
自来也（木叶）
纲手（木叶）
蝎父（沙隐）
蝎母（沙隐）
加藤断（木叶）
弥彦（雨忍）
长门（雨忍）
小南（雨忍）
主要事件
三忍大战山椒鱼半藏，得名“三忍”
自来也收留弥彦三人，发现了长门的“轮回眼”
纲手破解千代毒药
千代交手半藏
木叶白牙杀死蝎的父母，“木叶白牙”闻名天下
蝎开始学习傀儡术，几年后杀死了历代最强风影
加藤断重伤致死，使纲手开始对火影不敬并患上恐血症。
千手绳树误入爆炸符坑，被炸死。发现尸体时内脏被掏空。
这些就是二次忍界大战所发生的事情，而波风水门毕业后也参与了二次大战。二次大战期间拜师自来也，在忍界初出茅庐，为第三次忍界大战获得让人闻风丧胆的金色闪光名号做出铺垫。
不过这次有了宇智波芥，历史的车轮已经开始偏转。虽然在他毕业之前是不能做出任何改变，但是在他毕业以后，就是他那个计划施行的时候。